課程資訊
課程名稱
生物資訊學
BIOINFORMATICS 
開課學期
95-1 
授課對象
電機資訊學院  生醫電子與資訊學研究所  
授課教師
曾宇鳳 
課號
CSIE5036 
課程識別碼
922 U0370 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三5,6,7(12:20~15:10) 
上課地點
醫電腦室 
備註
與歐陽彥正、蔡孟勳合開 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/951bioinformatics 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

1 Introduction of bioinformatics 曾宇鳳
2 Introduction of genomics and its applications 蔡孟勳
3 From gene to genome: introduction to microarray 蔡孟勳
4 Microarray data analysis 蔡孟勳
5 Microarray and diseases 蔡孟勳
6 Current topics in bioinformatics I
7 Statistical data analysis in bioinformatics 歐陽彥正
8 Statistical data analysis in bioinformatics 歐陽彥正
9 Bioinformatics databases overview 曾宇鳳
10 Introduction of biological web services 蔡孟勳
11 Introduction of transcriptomics and applications 曾宇鳳
12 Introduction of proteomics, analysis and applications 曾宇鳳
13 Current topics in bioinformatics II
14 Protein sequence analysis: from protein sequence to structure 陳倩瑜
15 Protein sequence analysis: mining protein sequence motifs 陳倩瑜
16 Homology modeling of protein structures 林榮信
17 Protein-ligand interactions 林榮信 

課程目標
本課程將討論生物資訊學基本原理及實際應用,以使修習同學
能充分掌握如何運用電腦的處理能力,有效解決生醫研究上資料分
析,以及生物分子結構分析與功能預測。本課程包括多項電腦軟體
及資料庫使用的實習,但不包括程式撰寫. 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週四 15:00~16:00 
指定閱讀
 
參考書目
Introduction to Bioinformatics, by Arthur M. Lesk,
Microarray Analysis, by Mark Schena, 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
報告 
40% 
2 or 1 people in a group, present 2 papers at two current topics in bioinformatics classes 
2. 
出席 
20% 
 
3. 
期中考 
0% 
 
4. 
期末考 
40% 
Written exam 
5. 
作業 
0% 
 
6. 
報告 
50% 
2 or 1 people in a group, 10 minutes total present 2 papers at two current topics in bioinformatics classes, Email TA Paper Title, Group Names, Abstract "One" week before presentation. Paper has to be published after 01/01/2004 
7. 
出席 
10% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/20  Introduction of bioinformatics 
第2週
9/27  Introduction of genomics and its applications 
第3週
10/04  From gene to genome: introduction to microarray 
第4週
10/11  Microarray data analysis 
第5週
10/18  Microarray and diseases 
第6週
10/25  Current topics in bioinformatics I 
第7週
11/01  Statistical data analysis in bioinformatics 
第8週
11/08  Statistical data analysis in bioinformatics 
第9週
11/15  Bioinformatics databases overview 
第10週
11/22  Introduction of biological web services 
第11週
11/29  Introduction of transcriptomics and applications 
第12週
12/06  Introduction of proteomics, analysis and applications 
第13週
12/13  Current topics in bioinformatics II 
第13週
12/13  Protein sequence analysis: from protein sequence to function  
第14週
12/20  Protein sequence analysis: from protein sequence to structure 
第14週
12/20  Current topics in bioinformatics II 
第15週
12/27  Protein sequence analysis: mining protein sequence motifs 
第16週
1/03  Homology modeling of protein structures 
第17週
1/10  Protein-ligand interactions 
第18週
1/17  Final examination